Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NCOA1Q15788 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NCOA1Q15788 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
NCOA1Q15788 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCOA1Q15788 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
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