Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NECTIN1Q15223 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NECTIN1Q15223 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
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