Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
R3HDM1Q15032 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HDM1Q15032 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
R3HDM1Q15032 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
R3HDM1Q15032 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
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