Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH18Q13634 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH18Q13634 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH18Q13634 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms