Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTP4A2Q12974 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTP4A2Q12974 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTP4A2Q12974 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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