Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 DFM1YDR411C 1026 nt5.61□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 MNS1YJR131W 1650 nt5.61□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 SIS2YKR072C 1689 nt5.61□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 PTR2YKR093W 1806 nt5.61□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 JNM1YMR294W 1122 nt5.61□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 GAT1YFL021W 1533 nt5.6□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 STE12YHR084W 2067 nt5.59□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 FAA3YIL009W 2085 nt5.59□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 ASK10YGR097W 3441 nt5.59□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 HST3YOR025W 1344 nt5.59□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 UPS3YDR185C 540 nt5.59□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 RPT3YDR394W 1287 nt5.59□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 LDS1YAL018C 978 nt5.59□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 RFT1YBL020W 1725 nt5.59□□□□□ -1.51
HSP42Q12329 NGR1YBR212W 2019 nt5.58□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 YTP1YNL237W 1380 nt5.58□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SPO7YAL009W 780 nt5.58□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 CIN4YMR138W 576 nt5.58□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 YMC1YPR058W 924 nt5.58□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 MID1YNL291C 1647 nt5.58□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 ADE12YNL220W 1302 nt5.57□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 OCA1YNL099C 717 nt5.57□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 MDY2YOL111C 639 nt5.57□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 FAA4YMR246W 2085 nt5.57□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 STP4YDL048C 1473 nt5.57□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 GAL4YPL248C 2646 nt5.57□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 AMD2YDR242W 1650 nt5.56□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 YER084WYER084W 387 nt5.56□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 HPM1YIL110W 1134 nt5.56□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 CDC19YAL038W 1503 nt5.56□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 RGT1YKL038W 3513 nt5.56□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 ISN1YOR155C 1353 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 PRP40YKL012W 1752 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 EXG1YLR300W 1347 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 ALG2YGL065C 1512 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 YDL129WYDL129W 876 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 TAL1YLR354C 1008 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SPS18YNL204C 903 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 FRE1YLR214W 2061 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 VTC2YFL004W 2487 nt5.55□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 ZUO1YGR285C 1302 nt5.54□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 TFG1YGR186W 2208 nt5.54□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 SIP5YMR140W 1470 nt5.54□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 GON7YJL184W 372 nt5.54□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 YNL194CYNL194C 906 nt5.54□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 PFA3YNL326C 1011 nt5.54□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 RRS1YOR294W 612 nt5.54□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 UTP18YJL069C 1785 nt5.54□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 ADE3YGR204W 2841 nt5.54□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 LCB2YDR062W 1686 nt5.53□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 RHB1YCR027C 630 nt5.53□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 VCX1YDL128W 1236 nt5.53□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 CNL1YDR357C 369 nt5.53□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 RPT1YKL145W 1404 nt5.53□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 FPK1YNR047W 2682 nt5.53□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 HIR2YOR038C 2628 nt5.53□□□□□ -1.52
HSP42Q12329 ATR1YML116W 1629 nt5.52□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 ATP1YBL099W 1638 nt5.52□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 YNL228WYNL228W 777 nt5.52□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 UBP7YIL156W 3216 nt5.52□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 RET1YOR207C 3450 nt5.51□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 YDL119CYDL119C 924 nt5.51□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.51□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 ERI1YPL096C-A 207 nt5.51□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 SEG2YKL105C 3399 nt5.51□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 ASH1YKL185W 1767 nt5.5□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 FRE7YOL152W 1863 nt5.5□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 YCK1YHR135C 1617 nt5.5□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 TAF11YML015C 1041 nt5.5□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.5□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 MRPS16YPL013C 366 nt5.5□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 MRPS5YBR251W 924 nt5.5□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 LEU1YGL009C 2340 nt5.49□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 YEH1YLL012W 1722 nt5.49□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.49□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 PPG1YNR032W 1107 nt5.49□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 YNR040WYNR040W 771 nt5.49□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 PRI2YKL045W 1587 nt5.49□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 RFA1YAR007C 1866 nt5.49□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 BRL1YHR036W 1416 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 FRS2YFL022C 1512 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 ENT2YLR206W 1842 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 PRP43YGL120C 2304 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 BRF1YGR246C 1791 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 EAF5YEL018W 840 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 CBP4YGR174C 513 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 SSP120YLR250W 705 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 HAP3YBL021C 435 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 HSP78YDR258C 2436 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 DPH2YKL191W 1605 nt5.48□□□□□ -1.53
HSP42Q12329 MET3YJR010W 1536 nt5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34 ms