Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLFN5Q08AF3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SLFN5Q08AF3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms