Protein–RNA interactions for Protein: Q07657

SHS1, Seventh homolog of septin 1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHS1Q07657 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.55□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 RAT1YOR048C 3021 nt5.55□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 ASN1YPR145W 1719 nt5.54□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 HAS1YMR290C 1518 nt5.54□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 PTK2YJR059W 2457 nt5.54□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 YJL211CYJL211C 444 nt5.54□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 YNL019CYNL019C 855 nt5.54□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 YNL033WYNL033W 855 nt5.54□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 EFT2YDR385W 2529 nt5.54□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 EFT1YOR133W 2529 nt5.54□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 AMA1YGR225W 1782 nt5.54□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 NPL6YMR091C 1308 nt5.53□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 GLO2YDR272W 825 nt5.53□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 RPN12YFR052W 825 nt5.53□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 BUD28YLR062C 378 nt5.53□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 KEL1YHR158C 3495 nt5.53□□□□□ -1.52
SHS1Q07657 AVT3YKL146W 2079 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 RMD9YGL107C 1941 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 VMS1YDR049W 1899 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 APJ1YNL077W 1587 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 PDH1YPR002W 1551 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 MTC5YDR128W 3447 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 HEM3YDL205C 984 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 RRP45YDR280W 918 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 DCC1YCL016C 1143 nt5.52□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 ACS1YAL054C 2142 nt5.51□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.51□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 TBF1YPL128C 1689 nt5.51□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 LCP5YER127W 1074 nt5.51□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 HOR7YMR251W-A 180 nt5.51□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 STE50YCL032W 1041 nt5.51□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 SRP101YDR292C 1866 nt5.51□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 KIP2YPL155C 2121 nt5.51□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 DRS1YLL008W 2259 nt5.5□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 SMF3YLR034C 1422 nt5.5□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 LEM3YNL323W 1245 nt5.5□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 EEB1YPL095C 1371 nt5.5□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 DDC1YPL194W 1839 nt5.5□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 ATG7YHR171W 1893 nt5.49□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 FET3YMR058W 1911 nt5.49□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 MNN10YDR245W 1182 nt5.49□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 UTR4YEL038W 684 nt5.49□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.49□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 PRE7YBL041W 726 nt5.49□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 YNR042WYNR042W 429 nt5.49□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 SCO1YBR037C 888 nt5.49□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 RPL21BYPL079W 483 nt5.49□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 SIT1YEL065W 1887 nt5.49□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 VMA13YPR036W 1437 nt5.48□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 PCS60YBR222C 1632 nt5.48□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 UTP9YHR196W 1728 nt5.48□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 SEH1YGL100W 1050 nt5.48□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 CSM2YIL132C 642 nt5.48□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 RPA49YNL248C 1248 nt5.48□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 ARO10YDR380W 1908 nt5.48□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 RSA4YCR072C 1548 nt5.48□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 GCS1YDL226C 1059 nt5.47□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 COX17YLL009C 210 nt5.47□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 SWP1YMR149W 861 nt5.47□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 ALD6YPL061W 1503 nt5.47□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 VHT1YGR065C 1782 nt5.47□□□□□ -1.53
SHS1Q07657 BGL2YGR282C 942 nt5.46□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 YIL077CYIL077C 963 nt5.46□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 MSH1YHR120W 2880 nt5.46□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 RPT4YOR259C 1314 nt5.46□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 RPB4YJL140W 666 nt5.45□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 YOR024WYOR024W 324 nt5.45□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 VPS70YJR126C 2436 nt5.45□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 EMW1YNL313C 2715 nt5.44□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 YDR396WYDR396W 501 nt5.44□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 NAG1YGR031C-A 492 nt5.44□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 SKN1YGR143W 2316 nt5.44□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 YMR010WYMR010W 1218 nt5.44□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 SEC17YBL050W 879 nt5.44□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 KTR5YNL029C 1569 nt5.44□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 BRF1YGR246C 1791 nt5.44□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 YEL020CYEL020C 1683 nt5.43□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 EPS1YIL005W 2106 nt5.43□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 DOM34YNL001W 1161 nt5.43□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 YNL296WYNL296W 315 nt5.43□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 MRL1YPR079W 1146 nt5.43□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 SUB2YDL084W 1341 nt5.43□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 CLP1YOR250C 1338 nt5.43□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 TUB2YFL037W 1374 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 NOP7YGR103W 1818 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 ECM3YOR092W 1842 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 YHR145CYHR145C 357 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 JJJ3YJR097W 519 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 POR1YNL055C 852 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 PDB1YBR221C 1101 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 JEM1YJL073W 1938 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 SET5YHR207C 1581 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 ATG23YLR431C 1362 nt5.42□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 FOL1YNL256W 2475 nt5.41□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 SCM3YDL139C 672 nt5.41□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 AI5_BETAQ0075 1065 nt5.41□□□□□ -1.54
SHS1Q07657 REV7YIL139C 738 nt5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 72 ms