Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC63Q05C16 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRC63Q05C16 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC63Q05C16 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms