Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1Q04771 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVR1Q04771 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACVR1Q04771 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms