Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PAX2Q02962 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PAX2Q02962 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms