Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL6Q02878 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL6Q02878 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms