Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BEX3Q00994 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BEX3Q00994 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BEX3Q00994 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 559.2 ms