Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CLTCQ00610 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLTCQ00610 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLTCQ00610 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms