Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL23P62829 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL23P62829 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL23P62829 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL23P62829 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL23P62829 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL23P62829 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL23P62829 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL23P62829 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL23P62829 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL23P62829 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL23P62829 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL23P62829 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL23P62829 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL23P62829 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL23P62829 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL23P62829 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL23P62829 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL23P62829 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL23P62829 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL23P62829 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL23P62829 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL23P62829 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL23P62829 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL23P62829 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL23P62829 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL23P62829 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL23P62829 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL23P62829 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL23P62829 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL23P62829 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL23P62829 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL23P62829 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPL23P62829 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL23P62829 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL23P62829 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL23P62829 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL23P62829 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL23P62829 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL23P62829 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL23P62829 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL23P62829 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL23P62829 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms