Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAD23AP54725 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms