Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCT4P50991 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCT4P50991 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCT4P50991 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCT4P50991 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CCT4P50991 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCT4P50991 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCT4P50991 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCT4P50991 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCT4P50991 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCT4P50991 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCT4P50991 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCT4P50991 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCT4P50991 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCT4P50991 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCT4P50991 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCT4P50991 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCT4P50991 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCT4P50991 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT4P50991 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT4P50991 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT4P50991 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT4P50991 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT4P50991 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT4P50991 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT4P50991 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT4P50991 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT4P50991 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCT4P50991 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCT4P50991 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCT4P50991 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCT4P50991 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCT4P50991 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCT4P50991 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCT4P50991 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCT4P50991 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCT4P50991 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCT4P50991 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCT4P50991 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCT4P50991 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCT4P50991 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCT4P50991 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCT4P50991 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCT4P50991 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCT4P50991 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCT4P50991 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCT4P50991 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCT4P50991 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCT4P50991 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCT4P50991 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCT4P50991 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCT4P50991 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCT4P50991 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCT4P50991 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCT4P50991 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCT4P50991 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCT4P50991 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCT4P50991 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCT4P50991 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCT4P50991 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCT4P50991 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCT4P50991 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCT4P50991 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCT4P50991 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT4P50991 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT4P50991 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT4P50991 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT4P50991 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT4P50991 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT4P50991 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT4P50991 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCT4P50991 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCT4P50991 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCT4P50991 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCT4P50991 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCT4P50991 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCT4P50991 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCT4P50991 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCT4P50991 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCT4P50991 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCT4P50991 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCT4P50991 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCT4P50991 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCT4P50991 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCT4P50991 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCT4P50991 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCT4P50991 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCT4P50991 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCT4P50991 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCT4P50991 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms