Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRP3P50461 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRP3P50461 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms