Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GCLCP48506 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCLCP48506 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCLCP48506 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCLCP48506 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCLCP48506 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCLCP48506 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCLCP48506 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCLCP48506 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCLCP48506 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCLCP48506 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCLCP48506 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCLCP48506 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCLCP48506 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLCP48506 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLCP48506 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLCP48506 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLCP48506 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLCP48506 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GCLCP48506 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCLCP48506 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCLCP48506 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCLCP48506 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCLCP48506 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCLCP48506 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCLCP48506 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GCLCP48506 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GCLCP48506 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCLCP48506 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCLCP48506 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GCLCP48506 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCLCP48506 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCLCP48506 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCLCP48506 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCLCP48506 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLCP48506 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLCP48506 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLCP48506 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLCP48506 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLCP48506 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLCP48506 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLCP48506 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLCP48506 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLCP48506 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCLCP48506 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLCP48506 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLCP48506 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLCP48506 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLCP48506 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCLCP48506 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCLCP48506 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCLCP48506 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCLCP48506 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCLCP48506 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLCP48506 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLCP48506 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLCP48506 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLCP48506 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLCP48506 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLCP48506 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLCP48506 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCLCP48506 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCLCP48506 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLCP48506 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLCP48506 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLCP48506 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLCP48506 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLCP48506 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLCP48506 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLCP48506 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLCP48506 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCLCP48506 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCLCP48506 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCLCP48506 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCLCP48506 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCLCP48506 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCLCP48506 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GCLCP48506 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCLCP48506 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLCP48506 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLCP48506 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLCP48506 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLCP48506 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCLCP48506 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLCP48506 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLCP48506 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLCP48506 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLCP48506 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLCP48506 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCLCP48506 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms