Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MAGEA4P43358 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAGEA4P43358 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAGEA4P43358 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA4P43358 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms