Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP2P42575 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP2P42575 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP2P42575 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP2P42575 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP2P42575 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP2P42575 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP2P42575 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CASP2P42575 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP2P42575 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP2P42575 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP2P42575 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP2P42575 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP2P42575 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP2P42575 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP2P42575 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP2P42575 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP2P42575 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP2P42575 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP2P42575 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP2P42575 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP2P42575 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP2P42575 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP2P42575 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP2P42575 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP2P42575 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP2P42575 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP2P42575 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP2P42575 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP2P42575 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP2P42575 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP2P42575 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP2P42575 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP2P42575 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP2P42575 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP2P42575 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP2P42575 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP2P42575 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP2P42575 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP2P42575 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP2P42575 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP2P42575 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP2P42575 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP2P42575 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP2P42575 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP2P42575 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP2P42575 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP2P42575 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP2P42575 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP2P42575 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP2P42575 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP2P42575 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP2P42575 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP2P42575 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP2P42575 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP2P42575 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP2P42575 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP2P42575 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP2P42575 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP2P42575 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP2P42575 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP2P42575 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP2P42575 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP2P42575 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP2P42575 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP2P42575 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP2P42575 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP2P42575 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP2P42575 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP2P42575 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP2P42575 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP2P42575 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP2P42575 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP2P42575 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP2P42575 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms