Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN7P41732 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN7P41732 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN7P41732 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms