Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6V1E1P36543 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP6V1E1P36543 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP6V1E1P36543 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP6V1E1P36543 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP6V1E1P36543 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1E1P36543 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1E1P36543 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1E1P36543 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1E1P36543 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1E1P36543 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP6V1E1P36543 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms