Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHI3L1P36222 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms