Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGCLP35914 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMGCLP35914 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGCLP35914 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms