Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ABCC1P33527 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
ABCC1P33527 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ABCC1P33527 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms