Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SSFA2P28290 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SSFA2P28290 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SSFA2P28290 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms