Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB4P28070 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMB4P28070 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB4P28070 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms