Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMA5P28066 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMA5P28066 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMA5P28066 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMA5P28066 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMA5P28066 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMA5P28066 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMA5P28066 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PSMA5P28066 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PSMA5P28066 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMA5P28066 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMA5P28066 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PSMA5P28066 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PSMA5P28066 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMA5P28066 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMA5P28066 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMA5P28066 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMA5P28066 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMA5P28066 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMA5P28066 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMA5P28066 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms