Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK2P24941 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK2P24941 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK2P24941 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK2P24941 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK2P24941 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK2P24941 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK2P24941 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK2P24941 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK2P24941 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK2P24941 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK2P24941 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK2P24941 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK2P24941 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK2P24941 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK2P24941 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK2P24941 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK2P24941 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK2P24941 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK2P24941 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK2P24941 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK2P24941 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK2P24941 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK2P24941 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK2P24941 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK2P24941 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK2P24941 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK2P24941 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK2P24941 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK2P24941 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK2P24941 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK2P24941 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK2P24941 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK2P24941 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK2P24941 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK2P24941 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK2P24941 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK2P24941 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK2P24941 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK2P24941 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms