Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCP1P17987 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCP1P17987 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCP1P17987 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCP1P17987 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCP1P17987 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCP1P17987 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCP1P17987 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCP1P17987 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCP1P17987 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCP1P17987 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCP1P17987 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCP1P17987 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TCP1P17987 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCP1P17987 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCP1P17987 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCP1P17987 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCP1P17987 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCP1P17987 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCP1P17987 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCP1P17987 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCP1P17987 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCP1P17987 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCP1P17987 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCP1P17987 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCP1P17987 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCP1P17987 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCP1P17987 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCP1P17987 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCP1P17987 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCP1P17987 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCP1P17987 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCP1P17987 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCP1P17987 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCP1P17987 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCP1P17987 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCP1P17987 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCP1P17987 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCP1P17987 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCP1P17987 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCP1P17987 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCP1P17987 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCP1P17987 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCP1P17987 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCP1P17987 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCP1P17987 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCP1P17987 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCP1P17987 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCP1P17987 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCP1P17987 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCP1P17987 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCP1P17987 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCP1P17987 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCP1P17987 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCP1P17987 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCP1P17987 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCP1P17987 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCP1P17987 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCP1P17987 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCP1P17987 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCP1P17987 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCP1P17987 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCP1P17987 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCP1P17987 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCP1P17987 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCP1P17987 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCP1P17987 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCP1P17987 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCP1P17987 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCP1P17987 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCP1P17987 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCP1P17987 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCP1P17987 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCP1P17987 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCP1P17987 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCP1P17987 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCP1P17987 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP1P17987 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP1P17987 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP1P17987 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP1P17987 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP1P17987 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP1P17987 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP1P17987 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP1P17987 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP1P17987 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP1P17987 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCP1P17987 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCP1P17987 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms