Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN1P17029 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZKSCAN1P17029 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZKSCAN1P17029 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms