Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCK1P16333 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCK1P16333 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCK1P16333 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCK1P16333 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCK1P16333 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCK1P16333 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCK1P16333 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCK1P16333 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NCK1P16333 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NCK1P16333 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCK1P16333 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCK1P16333 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCK1P16333 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCK1P16333 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCK1P16333 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCK1P16333 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCK1P16333 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCK1P16333 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NCK1P16333 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCK1P16333 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCK1P16333 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NCK1P16333 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCK1P16333 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCK1P16333 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCK1P16333 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCK1P16333 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCK1P16333 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCK1P16333 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCK1P16333 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCK1P16333 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCK1P16333 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCK1P16333 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCK1P16333 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCK1P16333 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCK1P16333 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCK1P16333 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCK1P16333 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms