Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP3BO95985 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP3BO95985 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP3BO95985 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms