Protein–RNA interactions for Protein: O95478

NSA2, Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSA2O95478 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSA2O95478 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSA2O95478 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NSA2O95478 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSA2O95478 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NSA2O95478 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSA2O95478 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSA2O95478 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSA2O95478 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSA2O95478 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSA2O95478 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSA2O95478 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSA2O95478 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSA2O95478 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NSA2O95478 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSA2O95478 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSA2O95478 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSA2O95478 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSA2O95478 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSA2O95478 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSA2O95478 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSA2O95478 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSA2O95478 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSA2O95478 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSA2O95478 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSA2O95478 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSA2O95478 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSA2O95478 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSA2O95478 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSA2O95478 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSA2O95478 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSA2O95478 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSA2O95478 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSA2O95478 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSA2O95478 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NSA2O95478 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSA2O95478 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSA2O95478 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSA2O95478 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSA2O95478 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSA2O95478 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSA2O95478 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSA2O95478 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSA2O95478 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSA2O95478 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSA2O95478 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSA2O95478 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSA2O95478 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSA2O95478 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSA2O95478 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSA2O95478 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSA2O95478 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSA2O95478 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSA2O95478 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NSA2O95478 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSA2O95478 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSA2O95478 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSA2O95478 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSA2O95478 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSA2O95478 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSA2O95478 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NSA2O95478 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSA2O95478 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSA2O95478 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSA2O95478 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSA2O95478 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSA2O95478 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NSA2O95478 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms