Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNAPINO95295 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNAPINO95295 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms