Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEBLO76041 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEBLO76041 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEBLO76041 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEBLO76041 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEBLO76041 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEBLO76041 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEBLO76041 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEBLO76041 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEBLO76041 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEBLO76041 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEBLO76041 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEBLO76041 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEBLO76041 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEBLO76041 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEBLO76041 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEBLO76041 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEBLO76041 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEBLO76041 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEBLO76041 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEBLO76041 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEBLO76041 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEBLO76041 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEBLO76041 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEBLO76041 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEBLO76041 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEBLO76041 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEBLO76041 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEBLO76041 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEBLO76041 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEBLO76041 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEBLO76041 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEBLO76041 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEBLO76041 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEBLO76041 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEBLO76041 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEBLO76041 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEBLO76041 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEBLO76041 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEBLO76041 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEBLO76041 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.3 ms