Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEDO75530 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEDO75530 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEDO75530 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEDO75530 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEDO75530 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEDO75530 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEDO75530 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EEDO75530 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEDO75530 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEDO75530 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EEDO75530 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEDO75530 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEDO75530 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEDO75530 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEDO75530 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEDO75530 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEDO75530 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EEDO75530 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEDO75530 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEDO75530 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EEDO75530 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEDO75530 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEDO75530 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEDO75530 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEDO75530 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEDO75530 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEDO75530 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEDO75530 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEDO75530 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEDO75530 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEDO75530 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEDO75530 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEDO75530 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EEDO75530 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEDO75530 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEDO75530 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEDO75530 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEDO75530 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEDO75530 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEDO75530 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEDO75530 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEDO75530 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EEDO75530 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEDO75530 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEDO75530 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEDO75530 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEDO75530 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EEDO75530 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEDO75530 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEDO75530 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEDO75530 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEDO75530 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEDO75530 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEDO75530 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEDO75530 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEDO75530 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEDO75530 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EEDO75530 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms