Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRGAP2O75044 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRGAP2O75044 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2O75044 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms