Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRPX2O60687 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPX2O60687 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPX2O60687 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms