Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM1AO60341 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM1AO60341 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM1AO60341 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms