Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP8B1O43520 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP8B1O43520 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP8B1O43520 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.4 ms