Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IKBKBO14920 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IKBKBO14920 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IKBKBO14920 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IKBKBO14920 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IKBKBO14920 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms