Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SUPT5HO00267 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC41.94■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
SUPT5HO00267 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
SUPT5HO00267 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SUPT5HO00267 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SUPT5HO00267 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms