Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BNX3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BNX3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3BNX3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BNX3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BNX3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BNX3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BNX3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BNX3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BNX3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BNX3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3BNX3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3BNX3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BNX3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BNX3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BNX3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BNX3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BNX3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3BNX3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
H3BNX3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BNX3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BNX3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BNX3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BNX3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BNX3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BNX3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3BNX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BNX3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BNX3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BNX3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BNX3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BNX3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BNX3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BNX3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BNX3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H3BNX3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
H3BNX3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BNX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BNX3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BNX3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BNX3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BNX3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BNX3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BNX3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H3BNX3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H3BNX3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BNX3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BNX3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H3BNX3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H3BNX3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
H3BNX3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H3BNX3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
H3BNX3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BNX3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BNX3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H3BNX3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms