Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPA5E9PKD4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPA5E9PKD4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPA5E9PKD4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms