Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B4DGG1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
B4DGG1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DGG1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DGG1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DGG1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DGG1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DGG1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DGG1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DGG1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DGG1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DGG1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DGG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DGG1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DGG1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DGG1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DGG1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DGG1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DGG1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DGG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DGG1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DGG1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DGG1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DGG1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DGG1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DGG1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DGG1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DGG1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DGG1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DGG1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DGG1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DGG1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DGG1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DGG1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DGG1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DGG1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DGG1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DGG1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DGG1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DGG1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DGG1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DGG1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DGG1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DGG1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DGG1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DGG1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DGG1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DGG1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DGG1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DGG1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DGG1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DGG1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DGG1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DGG1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DGG1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DGG1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DGG1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DGG1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DGG1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DGG1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DGG1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DGG1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DGG1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DGG1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DGG1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DGG1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DGG1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DGG1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DGG1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DGG1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DGG1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DGG1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DGG1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DGG1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DGG1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms