Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SF3B2-214ENST00000533595 1081 ntTSL 513.85□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.362e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 KLC1-211ENST00000538504 822 ntTSL 221.87■■□□□ 1.092e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.952e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 KLC1-226ENST00000557686 535 ntTSL 320.68■□□□□ 0.92e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.862e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 TSC2-226ENST00000569930 2621 ntTSL 219.74■□□□□ 0.752e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.672e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 TSC2-225ENST00000569110 1687 ntTSL 516.59■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 ZMIZ2-208ENST00000463056 3240 ntTSL 215.19■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 TMEM214-206ENST00000435172 1480 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.097e-7■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 ZMIZ2-210ENST00000478045 3549 ntTSL 1 (best)14.23□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 LARS-213ENST00000511505 1089 ntTSL 512.41□□□□□ -0.422e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 TMEM214-211ENST00000475258 927 ntTSL 212.25□□□□□ -0.452e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.462e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 UBE2D3-231ENST00000513098 702 ntTSL 311.95□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-218ENST00000527659 2436 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 PRPF4B-206ENST00000481109 2364 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.692e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.732e-6■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 210.44□□□□□ -0.742e-6■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.842e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.852e-6■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 EPB41L2-233ENST00000639623 3395 ntTSL 57.02□□□□□ -1.292e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-212ENST00000526333 549 ntTSL 56.69□□□□□ -1.342e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.42e-6■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.52e-6■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 UBE2V1-209ENST00000461960 649 ntTSL 53.97□□□□□ -1.772e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 32.58□□□□□ -22e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 55.65□□□□□ -1.512e-6■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.642e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 SPTBN1-205ENST00000496323 2225 ntTSL 213.94□□□□□ -0.182e-7■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.128e-8■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.711e-11■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.769e-8■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.816e-8■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 PACSIN3-210ENST00000533686 443 ntTSL 315.72■□□□□ 0.116e-8■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 PIM3-202ENST00000467480 723 ntTSL 230■■■□□ 2.391e-10■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 FNDC3B-212ENST00000494000 2600 ntTSL 1 (best)6.74□□□□□ -1.332e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 516.41■□□□□ 0.224e-6■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.324e-6■□□□□ 8.4
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PRPF4O43172 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.474e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.494e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.554e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.569e-8■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.545e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.975e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.85e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.765e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.585e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.495e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.375e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.285e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-212ENST00000591041 812 ntTSL 322.83■■□□□ 1.255e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-214ENST00000592483 431 ntTSL 522.81■■□□□ 1.245e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.95e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 HMGCS1-206ENST00000511774 500 ntTSL 417.93■□□□□ 0.465e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.365e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 N4BP1-202ENST00000564124 2485 ntTSL 514.09□□□□□ -0.155e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 HMGCS1-203ENST00000507004 950 ntTSL 213.83□□□□□ -0.25e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 P4HB-209ENST00000474712 390 ntTSL 212.19□□□□□ -0.465e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 HMGCS1-204ENST00000507293 708 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.655e-9■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 SPON2-211ENST00000507466 525 ntTSL 221.88■■□□□ 1.092e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 SPON2-208ENST00000504909 551 ntTSL 420.09■□□□□ 0.812e-6■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-210ENST00000458280 553 ntTSL 420.94■□□□□ 0.947e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-208ENST00000412911 560 ntTSL 416.37■□□□□ 0.217e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-217ENST00000490700 661 ntTSL 315.41■□□□□ 0.067e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-201ENST00000312283 785 ntTSL 314.76□□□□□ -0.057e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-215ENST00000476384 936 ntTSL 514.52□□□□□ -0.097e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.137e-15■□□□□ 8.4
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