Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQA8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQA8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQA8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQA8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQA8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQA8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQA8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQA8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQA8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQA8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQA8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQA8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQA8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQA8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQA8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQA8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQA8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQA8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQA8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQA8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQA8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U3KQA8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U3KQA8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U3KQA8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U3KQA8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
U3KQA8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U3KQA8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQA8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQA8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQA8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQA8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQA8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQA8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQA8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQA8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQA8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQA8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQA8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQA8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQA8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQA8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQA8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQA8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQA8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQA8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQA8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQA8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQA8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQA8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQA8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQA8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQA8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQA8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQA8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQA8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQA8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQA8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQA8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQA8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U3KQA8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQA8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQA8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQA8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQA8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQA8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQA8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U3KQA8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQA8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQA8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQA8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQA8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQA8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQA8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U3KQA8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U3KQA8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms