Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC23IPQ9Y6Y8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC23IPQ9Y6Y8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms